东南大学，作为985和211工程院校，其历史渊源可追溯至南京大学的工学院部分院系。如今的东南大学校园，正是建立在南京大学的旧址之上。

西北工业大学，同样隶属于985和211工程，其前身是以南京大学工学航空系为主要部分组建而成。

电子科技大学，则以南京大学工学院电子工程系有线电部为主要组成部分，成为了一所985和211工程的重点院校。

河海大学，作为211工程院校，其主体来自于南京大学工学院的水利系。

南京师范大学，也是一所211工程院校，它的前身是南京大学师范学院。

南京农业大学，作为另一所211工程院校，其主体则是南京大学农学院。

江南大学，则以南京大学工学院食品工程系为主要组成部分，成为了一所211工程院校。

另外，南京大学医学院也成为了中央音乐学院211工程院校的组成部分。

上海财经大学同样位列211工程院校，它的前身是南京大学商学院。除此之外，南京工业大学、南京信息工程大学等院校，也都以南京大学分拆部分为主体或主要部分。