曲阜师范大学拥有多项国家级一流本科专业，其中教育学、物理学、思想政治教育、教育技术学、体育教育、汉语言文学、数学与应用数学、统计学、英语、化学、地理科学、自动化、计算机科学与技术、软件工程、生物科学、物流管理、戏剧影视文学、视觉传达设计、经济学、历史学、运动训练、旅游管理、音乐学、政治学与行政学、学前教育、新闻学和电子信息工程等专业被评为国家级一流本科专业，这些专业在2019年至2021年期间获得此荣誉。

此外，曲阜师范大学还拥有多项省级一流本科专业，包括翻译、生物工程、工商管理、美术学、信息与计算科学、心理学、哲学、法学、俄语、应用统计学、电气工程及其自动化、光电信息科学与工程、网络工程、化学工程与工艺和土地资源管理等专业被评为省级一流本科专业，这些专业在2019年至2021年期间获得此荣誉。