兰州大学研究生学费标准分为学术型研究生和专业学位研究生两类。学术型研究生中，文、史类硕士研究生学费标准为每年9000元；理、工、农、医类硕士研究生学费标准为每年10000元；艺术类硕士研究生学费标准为每年12000元；博士研究生各专业学费标准均为13000元。专业学位研究生的学费标准则依据不同专业而异，应用统计、金融、法律（非法学、法学）、社会工作、汉语国际教育、翻译、新闻与传播、会计专业学位研究生学费标准为每年9000元；工程、农业推广专业学位研究生学费标准为每年8000元；临床医学、口腔医学、公共卫生、药学、公共管理专业学位研究生学费标准为每年10000元；国际工商管理（IMBA）专业学位研究生学费标准为每年30000元；其他工商管理（MBA）专业学位研究生学费标准为每年15000元；临床医学博士专业学位研究生学费标准均为每年13000元。

对于不需要统一安排住宿的新生，报到时需前往西安区学生公寓中心获取不住宿的书面证明，并据此前往财务处办理住宿费标准调整手续，以避免缴纳住宿费。研究生新生缴费收据是缴纳费用的有效凭据，也是唯一的合法凭据，务必妥善保管。