如果是女生学习微生物，要先考虑导师是从事什么方面的研究的，如果导师是利用微生物为研究材料而搞分子方面的研究，或者是从事病毒或致病菌的研究，劝你还是三思，因为分子试剂有毒和致癌，致胎儿畸形的比较多，停止分子实验后三年内最好不要生育。

微生物制药尤其是基因药物的研究是个不错的方向，前景广阔。

另外食品微生物与生产结合紧密，也是不错的选择。

如果不想吃苦，可以考虑做微生物的基础研究，比如分类鉴定等，这一块向来是女生的天下。