朱永官目前承担的科研项目涵盖了多个领域，涉及环境科学、生物地球化学、微生物生态学以及土壤学等。这些项目主要聚焦于土壤关键生物地球化学过程与环境功能、碳氮铁耦合过程的微生物生态学机制、持久性有毒物质在土壤-水稻界面的联合作用机理研究、水稻砷污染的遗传和环境控制因子研究、水稻根表铁膜形成的微生物学过程及其机理研究以及地下水砷污染与有机物的关联等多个方向。

其中包括国家自然科学基金重大项目，总经费1000万元，该项目从2011年1月至2014年12月，旨在研究典型稻田土壤关键生物地球化学过程与环境功能。此外，还有国家自然科学基金项目，总经费416万元，从2011年1月至2014年12月，该项目主要探讨典型水稻土碳氮铁耦合过程的微生物生态学机制。这些项目不仅在国内开展，还包括国际合作重大项目，如与英国生物技术与生命科学研究理事会合作的亚洲地区水稻砷污染研究项目，以及与瑞士洛桑理工学院合作的中国地下水砷污染与有机物关联研究项目，还有与英国阿伯丁大学合作的关于城市群环境复合污染与生态健康的研究。

这些科研项目不仅为解决土壤污染、环境污染以及生态健康等全球性问题提供了理论基础和实践指南，同时也为推动相关领域的科技进步和国际合作贡献了力量。通过这些项目，朱永官及其团队深入研究了土壤和水体中污染物的迁移、转化和生物地球化学循环机制，为环境治理、生态系统保护和可持续发展提供了科学依据和策略。