通常人们会认为南京大学和南京大学商学院是两个不同的机构，尽管它们之间的关系紧密。

南京大学作为一所历史悠久、学术声誉卓著的综合性大学，在中国高等教育体系中占据着重要地位。而南京大学商学院则作为其下属学院之一，专注于培养商科领域的专业人才。这两者之间存在层级上的差异，南京大学作为大学整体，其规模和影响力显然要大于商学院。

尽管商学院隶属于南京大学，但它依然具备独立的教学与研究职能，能够在商科教育和研究方面发挥独特的作用。南京大学商学院的设置，体现了大学内部学科结构的多样性和完整性，同时也为学生提供了更广阔的学习和发展空间。

此外，南京大学商学院与南京大学其他学院在资源共享、学术交流等方面也有着密切的联系，共同推动了学校整体学术水平的提升。

简而言之，南京大学和南京大学商学院虽然名称上有相似之处，但从实际运作来看，它们各自承担着不同的职能和使命，是两个独立但又相互支持的教育机构。

南京大学商学院作为南京大学的一个重要组成部分，其目标是为社会培养具有深厚理论基础和实际操作能力的商科人才，而南京大学则致力于提供全面的学术环境和资源，以支持各个学院的发展。