计算机科学与技术下设的二级学科主要包括以下几个方面：

1. **计算机系统结构**：该学科主要研究计算机系统的硬件和系统结构，涉及处理器设计、内存管理、输入输出系统等方面，致力于提高计算机系统的性能和效率。

2. **计算机软件与理论**：这一学科关注软件开发的理论基础，包括软件工程、程序设计语言、形式化方法等，旨在提升软件开发的质量和可维护性。

3. **计算机应用技术**：该学科研究计算机技术在各个领域的应用，如工业自动化、生物信息学、教育等，通过计算机技术的应用推动相关领域的进步和发展。

此外，还有一些相关的二级学科，如网络工程、数据科学与大数据技术、人工智能、信息安全等，这些学科从不同角度对计算机科学与技术进行深入研究，为计算机领域的发展提供了丰富的理论和技术支持。这些二级学科为研究生提供了多样化的研究方向和职业发展机会，有助于培养全面发展的计算机专业人才。