重庆三峡学院的5009与9107是两个不同类型的本科专业。5009为普通本科专业，学费大约在5000元左右。而9107则属于应用技术专业，它是由校企联合举办的，因此其学费相对较高，大约是5009的两倍，即在10000元左右每年。值得注意的是，尽管学费有差异，但两者的毕业证书并无任何区别。

9107专业是在2017年开始首次招生的，但由于宣传不足，今年的录取分数线非常低，甚至二本分数线的考生也能被录取。这说明9107专业在招生时面临了一定的挑战，需要吸引更多的学生。

总结而言，5009与9107之间的主要区别在于专业性质与学费上。5009专业为普通本科，学费较低，而9107则属于应用技术专业，学费较高。尽管如此，两者的毕业证书是一致的。此外，9107专业在招生时面临了一定的挑战，今年的录取分数线相对较低。