济宁医学院收费项目包括专业注册学费和学分学费。学分制收费按照鲁价费函[2018]72号、鲁教财函文件[2019]19号文件执行。专业注册学费按学年收取，需在学生报到前交纳。学分学费按学期收取，实行先选课后交费，每学分为100元。若未实行学分制收费，则按照鲁价费发[2013]136号文件执行。具体收费如下：中外合作办学护理学专业19500元/生·学年，校企合作护理学专业10400元/生·学年、计算机科学与技术专业9600元/生·学年，药学、英语、公共事业管理、市场营销专业8800元/生·学年。

住宿费方面，根据鲁发改成本［2019］804号文精神，济宁太白湖校区暂预收1000元、济宁任城校区暂预收800元、高教园区暂预收1200元、日照校区暂预收1100元。学生入校后，住宿费根据实际住宿情况多退少补。