分类比较多，通过北京大学官网的分类如下：合计分为八个学部，共计8个学院

理学部：八个学院6

数学科学学院、物理学院、化学与分子工程学院、生命科学学院、城市与环境学院、地球与空间科学学院、心理与认知科学学院、建筑与景观设计学院

信息与工程科学部：六个学院

信息科学技术学院、工学院、王选计算机研究所、软件与微电子学院、环境科学与工程学院、软件工程国家工程研究中心

社会科学学部：九个学院

国际关系学院、法学院、信息管理系、社会学系政府管理学院、马克思主义学院、教育学院、新闻与传播学院、体育教研部

人文学部：八个学院

中国语言文学系、历史学系、考古文博学院、哲学系（宗教学系）、外国语学院、艺术学院、对外汉语教育学院、歌剧研究院

医学部：十六个学院

基础医学院、药学院、公共卫生学院、护理学院、医学人文学院、医学继续教育学院、第一医院、人民医院、第三医院、口腔医院、北京肿瘤医院、第六医院、深圳医院（共建）、首钢医院（共建）、国际医院（共建）、滨海医院（共建）

经济与管理学部：四个学院

经济学院、光华管理学院、人口研究所、国家发展研究院

跨学科类：八个学院

元培学院、分子医学研究所、北京国际数学研究中心、前沿交叉学科研究院、核科学与技术研究院、燕京学堂、现代农学院、人工智能研究院

深圳研究生院：九个

深圳研究生院、信息工程学院、化学生物学与生物技术学院、环境与能源学院、城市规划与设计学院、新材料学院、汇丰商学院、国际法学院、人文社会科学学院

北京大学：学部和学院