北京大学的历史可以追溯到1898年，这一年正值维新变法时期，它最初的名字是京师大学堂，是中国近代史上第一所国立综合性大学，也是当时的国家最高教育管理机构。

1912年，它正式改名为国立北京大学，标志着其作为现代高等教育机构的重要地位。

1937年，由于战争的影响，北京大学迁至长沙，并与清华大学和南开大学共同组成了国立长沙临时大学。在1938年，学校又迁到了昆明，并更名为国立西南联合大学。

到了1946年，北京大学重新回到了北平，继续其教育使命。

1952年，北京大学转型为以文理基础学科为主的综合性大学，并且从北京沙滩等地搬到了现在的地址。

2000年，北京大学与原北京医科大学合并，创建了新的北京大学，进一步扩大了其在医学领域的影响力。