由超氧离子产生，如胺氧化酶，L－与D－氨基酸氧化酶，黄嘌呤酶等可以催化底物氧化而产生过氧化氢。

在粒细胞和吞噬细胞中，H2O2可氧化杀死入侵的细菌；甲状腺细胞中产生的H2O2可使2I-氧化成I2，进而使酪氨酸碘化生成甲状腺激素，但是过多的过氧化氢会对机体有毒害作用，超氧离子可进一步生成H2O2和羟自由基（.OH），对DNA可使其氧化，修饰，甚至断裂，对脂质和蛋白质也有一定的毒害作用