区别大了，工程硕士又叫专业硕士，学制为两年，主要为企业定向培养的专业型人才。而另一个则称学术型硕士，学制为三年，主要培养研究型人才的。

南京大学复试线现在还没有出来，南京农业大学一般就是国家线，不高。这个专业发展前景是非常好的，在国外得到了足够的重视，从业人员收入都很高。近年来在国内发展的也非常不错，保守估计每年这个专业缺少环境工程师大约有40万，所以这个专业在目前看来即使热门专业也是一个非常流行的专业。

现在研究生没有公费制度了，但有奖学金制度，和公费差不多