哈尔滨工业大学深圳研究生院并非与本部合并，而是哈工大设立的一个独立校区。深圳研究生院的师资力量和部分实验室直接来源于本部，保证了教育质量的延续，毕业生的学历证书与本部完全一致，可以说是研究生教育的一个分支，类似于本部的第二学区。大部分学生选择深圳校区是因为其良好的学习环境。

在专业硕士和学术型硕士的培养上，深圳研究生院与本部并无差别。无论是课程设置还是教学方式，两者的标准是一致的。学术型硕士和专业硕士的录取分数线可能会有所不同，专业硕士通常分数线略低，这是大家需要注意的一个点。然而，这并不影响深圳研究生院的教育质量，许多学生还是愿意选择深圳，因为那里提供了优质的教育资源和生活环境。

总之，哈尔滨工业大学深圳研究生院与本部在本质上是相同的，只是地理位置和部分资源的差异，而教育质量和硕士生的培养标准是一致的。分数的高低主要是由硕士类型的划分决定的，并非分校不如本部。希望这些信息对你有所帮助。