大连理工大学与南京航空航天大学相比，大连理工大学在机械工程领域占据优势。大连理工大学的机械工程专业作为其王牌之一，拥有强大的学术实力和研究资源。相比之下，南京航空航天大学虽然在机械工程方面也表现出色，但其专业设置更侧重于航空航天领域，因此在机械工程的具体应用方面可能略逊一筹。

从另一个角度看，大连理工大学机械工程专业隶属于教育部与国家国防科技工业局共建的高校体系，这意味着它在科研资源和项目支持上具有更多优势。相比之下，南京航空航天大学作为新中国最早建立的航空高等院校之一，虽然在航空航天领域有着深厚的历史积淀，但在与机械工程相关的教学资源和项目支持方面可能不如大连理工大学。

综合来看，大连理工大学在机械工程领域的优势更为明显，特别是在科研资源和项目支持方面。南京航空航天大学虽然在航空航天领域具有显著优势，但在机械工程方面的应用可能不如大连理工大学广泛和深入。

因此，在考虑机械工程专业的选择时，学生可以依据自己的兴趣和职业规划进行选择。对于希望在机械工程领域深入发展，并且更看重科研资源和项目支持的学生，大连理工大学可能是更好的选择。而对于对航空航天领域有浓厚兴趣的学生，南京航空航天大学则是一个不错的选择。