研究生保留学籍的档案处理方法主要有以下几点。首先，对于还未报到的研究生，可以保留入学资格。对于在读研究生，则可以申请休学一年，保留学籍。

根据《2017年全国硕士学位研究生招生工作管理规定》，第六十六条明确规定：被录取的新生，在考生本人申请且招生单位同意后，可以保留入学资格，工作1至2年，再入学学习。

具体操作时，建议咨询培养单位的研究生院或研招办。只要研究生本人提出书面申请，并获得批准，就可以保留入学资格或保留学籍。