哈尔滨工程大学，作为我国著名的高等学府，其前身是哈尔滨军事工程学院船舶系，拥有悠久的历史和深厚的学术底蕴。学校在船舶工程和水声自动化这两个专业上表现尤为出色，其中水声自动化专业尤其值得推荐。

水声自动化专业是哈尔滨工程大学的双一流学科，该专业在中国处于领先地位，是唯一一所培养水声、声纳等技术人才的学校。这一专业不仅师资力量雄厚，而且科研设施先进，为学生提供了良好的学习和研究环境。

相比之下，船舶工程专业则显得逊色一些。尽管学校在这一领域也有一定的教学和研究实力，但与上海交通大学、西安交通大学和西北工业大学等名校相比，仍存在一定的差距。这些学校的船舶工程专业在国内外享有较高的声誉，拥有更为先进的技术和更广阔的学术视野。

总体来看，对于对水声自动化技术感兴趣的学生来说，哈尔滨工程大学无疑是最佳选择。而对于船舶工程领域，尽管哈工程也有一定的实力，但如果希望获得更全面的教育和更广泛的视野，或许需要考虑其他更为知名的高校。

值得一提的是，哈尔滨工程大学不仅在专业设置上具有优势，而且在科研项目和学术成果方面也有显著的表现。学校与国内外多家企业和科研机构有着紧密的合作关系，为学生提供了丰富的实践机会和就业前景。

综上所述，哈工程的水声自动化专业在专业设置、科研实力和就业前景等方面均表现出色，是值得推荐的专业之一。而船舶工程专业虽然也有一定的实力，但在与国内顶尖高校的竞争中略显不足。