在职研究生和同等学力申硕的区别有三点。第一，入学方式不同；第二，所获证书不同；第三，报考条件不同。

同等学力申硕是在职研究生的一种，在职研究生和同等学力申硕属于包含与被包含的关系。通过同等学力申硕的方式可以报考在职研究生课程学习，而在职研究生的报考方式中包括同等学力申硕。

如果您想要更多的学术研究经验和更深入的学术知识，可以选择同等学力申硕；如果您想要更快地获得硕士学位并且不想放弃工作，可以选择在职研究生。