当然可以。

无论是学术硕士还是专业硕士，按照规定都有资格报名参加博士研究生招生考试。具体到同济大学控制科学与工程专业的专业硕士，考博方面也同样没有障碍。

实际上，不少专业硕士在完成学业后，选择继续深造以获得更高的学位。对于同济大学控制科学与工程专业的专业硕士来说，只要符合博士生招生的基本条件，比如学术成绩、科研能力等，就可以申请参加博士研究生的考试。

值得注意的是，虽然专业硕士可以考博，但具体的招生政策和要求可能会因学校和专业而异。因此，建议在申请之前，仔细查阅同济大学控制科学与工程专业的博士招生简章，确保自己符合所有条件。

此外，申请博士研究生时，除了关注考试要求，还需要准备个人陈述、研究计划等材料。这些材料能够帮助评审委员会更好地了解你的学术背景、研究兴趣和未来规划。

总之，同济大学控制科学与工程专业的专业硕士是可以考博的，只要符合相关条件并做好充分的准备，就有机会进入博士阶段的学习。