东南大学情报科学技术研究所的研究方向涵盖了多个领域，旨在推动图书馆学与信息技术的深度融合。

首先，图书馆学理论与方法方向关注图书馆资源管理、馆藏发展、分类编目等核心理论问题，强调理论与实践的结合，尤其注重信息技术在图书馆知识管理中的实际应用，旨在提升信息咨询和服务质量。

其次，数字图书馆技术方向侧重于数字化环境下的数字资源开发与利用，研究内容包括异构资源集的索引处理、开放链接、多媒体信息保藏以及智能化的数字资源管理技术。

图书馆管理与建筑研究方向则涵盖了图书馆的管理策略、个案研究、发展战略分析，以及馆际合作和资源共享等实践问题。同时，图书馆建筑规划与空间设计也是该领域的重点，研究图书馆物理空间的组织和功能，以及信息生态的构建。

信息组织与检索专业方向研究信息的获取、存储和检索方法，包括文本检索、数据挖掘、信息过滤等技术，致力于提高信息检索的效率和准确性。

最后，档案管理理论与方法方向则致力于培养具备系统档案学知识和应用型档案管理技能的专业人才，以适应现代档案管理的需求。