软件学院和计算机科学与技术在本科阶段大致差不多，很多课程是相同的，比如操作系统，数据结构等，由于软院是信科院分出去的，很多老师也是相同的，区别在于信科院录取分数线要高，他们在硬件方面的比如电路与模拟电子技术课程上学的比软件工程要深，但是软件工程更偏向于系统化地编写大型程序，所以更偏向于工程类学科，而计算机科学更偏向于计算，数学模型，更偏向于理科，所以有些学校计算机科学是授予理学学士的（中大软件与计科都是工学学士）；另外不同的一点是，信科院学风比软院好。至于移动信息工程学院，这是中大今年新办的一个学院，据说四年都在珠海校区，说的是什么云计算等流行的互联网新概念，其实都是信息类学科，差不多的，什么并行计算等，计科、软件工程都要学的，这个院我也不了解，不过个人推荐先报信科院，至于软院与移动信息工程学院就看你自己的了