中国成本研究会的最高权力机构是全体成员的代表大会，这个代表大会由团体会员和个人会员选举产生。其主要职责包括讨论和决定本会的工作方针和任务，听取并审议理事会的工作报告，选举或改选理事会成员，修订本会的章程，以及处理其他重大事务。代表大会每四年举行一次，大会闭幕期间，理事会则负责日常的会务管理和决策。

理事会由若干名理事组成，会中还设有常务理事会，包括常务理事、会长、副会长、秘书长和副秘书长等职务。常务委员会下设秘书处，主要由秘书长和副秘书长负责日常的工作运营。

本会的资金来源主要来自三个方面：一是来自相关部门的补助；二是本会自身的事业收入；三是每位会员缴纳的会费。本会的章程在经过会员代表大会的审议通过后开始实施，并在必要时进行修改。

本会的总部设在北京，这里也是各项活动和决策的核心区域。