3个一级学科：0908水产学、0710生物学、食品科学与工程

21个二级学科博士点：水产学一级学科下就有090801 水产养殖、090802 捕捞学、090803 渔业资源还有上海海洋大学自主设置的两个：0908Z1渔业环境保护与治理 ；0908Z2 渔业经济与管理共5个

生物学下有

071001 植物学

071002 动物学

071003 生理学

071004 水生生物学

071005 微生物学

071006 神经生物学

071007 遗传学

071008 发育生物学

071009 细胞生物学

071010 生物化学与分子生物学

071011 生物物理学

共计11个

食品科学与工程下有4个

083201 食品科学

083202 粮食、油脂及植物蛋白工程

083203 农产品加工及贮藏工程

083204 水产品加工及贮藏工程

共20个，因为生物学一级学科以前包括071012生态学，估计上海海洋大学是按着以前的学科分类来的，所以加上生态学21个

10个一级学科硕士：水产学、海洋科学、生物学、机械工程、计算机科学与技术、环境科学与工程、农林经济管理、食品科学与工程、生态学、软件工程 具体二级学科太多，自己可以按着国家大类相加的，可能部分专业不招生，具体招生专业见2014招生目录（上海海洋大学招生信息网）