上海交通大学机动学院的车辆工程专业专注于汽车领域的研究，涵盖了汽车设计、制造、测试和维护等方面的知识。相比之下，同济大学的车辆工程专业则更为广泛，不仅包括汽车相关领域，还涉及铁路和公路建设，提供了更全面的专业知识。从专业全面度来看，同济大学的车辆工程专业更具优势。

在考试分数方面，本科阶段报考上海交通大学机动学院车辆工程专业的竞争较为激烈。该专业的录取分数线相对较高，对考生的学术能力和综合素质要求严格，因此难度较大。而研究生阶段，两者之间的录取难度较为接近。虽然上海交通大学在本科阶段的竞争更为激烈，但在研究生阶段，两所大学的录取难度相似。

综上所述，考生在选择报考上海交通大学机动学院的车辆工程专业时，需要考虑自身的学术背景和兴趣爱好。如果对汽车领域有浓厚兴趣，且希望在本科阶段获得较好的专业基础，可以选择上海交通大学。而如果希望在车辆工程领域获得更全面的知识，建议选择同济大学的车辆工程专业。同时，考生在选择报考时，还需关注两所大学的具体招生政策和录取分数线。