北京生物研修学院的院系设置丰富多样，涵盖了多个学科领域，旨在为学生提供广泛的专业选择。学校目前设有以下院系：

法学院

工商企业管理学院

医学院

计算机学院

国际贸易学院

金融学院

财经学院

艺术学院

财会学院

机械工程学院

行政管理学院

外语学院

信息工程学院

环境与科学系

工业工程系

交通管理学院

化工学院

食品工程系

航空系

体育系

动物医学系

哲学系

印刷系

物流管理系

汽车工程学院

影视动漫学院

新闻传媒学院

网络教育学院

这些院系涵盖了工、文、经、管、法、医、艺术等多个专业，旨在培养具有前瞻性和后延性的专业人才，以适应不断变化的就业市场需求。