培养方式不同，目标不同。

1、培养方式不同：工程博士以化工、电子、机械、航空、轨道等高科技领域为主，是国家工程科技中的中坚力量。专业型博士的培养课程灵活多样，在课程设置和实践环节上都有所创新。

2、目标不同：专业型博士旨在培养博士生的实践与应用能力，将学术理论与产业需求结合起来，注重实践与成果的产出。工程博士则更加注重科研创新，鼓励博士生在基础理论和应用实践上有所发展，在工程领域注重创新。