许昌学院目前拥有多个科研机构，主要包括以下几个：

1. 物理科学与技术研究所

2. 化学与环境工程研究所

3. 生命科学研究所

4. 资源利用与环境保护研究所

5. 数学与信息科学研究所

6. 计算机科学与技术研究所

7. 教育科学研究所

8. 经济管理研究所

9. 法学研究所

10. 中国特色社会主义理论研究中心

11. 民族与宗教研究中心

以上是许昌学院目前较为知名的科研机构，除此之外，学院还设有一些学科和实验室等单位，在进行科学研究方面也发挥了重要作用。

学校有6个河南省重点学科，有河南省重点实验室、河南省工程实验室、河南省国际联合实验室、河南省院士工作站、河南省工程研究中心、河南省重点社会科学研究基地、河南省高校人文社科重点研究基地等14个省级科研创新平台。

设有河南省非物质文化遗产研究基地等，与地方重点企业联合成立有17个校级协同创新中心和产学研合作基地。