中国电科院和国网电科院，作为国家电网旗下研究与产业一体的单位，虽然同属国家电网，但在研究、产业及待遇方面存在显著差异。

中国电科院专注于科研工作，以科研为主要任务，而国网电科院，即南瑞集团，转型为以产业为主的集团，着重于产业开发与运营，强化了南瑞集团的名号。这一转变导致了中国电科院与国网电科院在职能定位上的区分，中国电科院保持科研机构的纯粹性，而国网电科院则更侧重于产业的发展与壮大。

在待遇方面，领导层在两院间呈现出差异。中国电科院可能提供相对稳定且专注于科研发展的环境，为科研人员提供良好的研究条件与发展空间。而国网电科院，作为产业集团，可能会提供更为多样化的职业路径与更高的职位晋升机会。南瑞继保作为南瑞集团下的民营性质子公司，虽然与南瑞集团有股权关系，但其独立性较高，领导层的待遇可能更为优厚，员工待遇一般。

南瑞集团作为国网电科院转型后的产业集团，现下辖二十多家产业公司，南瑞科技作为其中最大的子公司，以股份公司的形式存在。南瑞继保作为由院士沈国荣创立的公司，虽然与南瑞集团有股权联系，但其民营性质使得其在管理与运营上保持一定的自主性。在待遇方面，领导层可能享有较高的薪酬待遇，而员工待遇则相对一般。

综上所述，中国电科院与国网电科院在研究、产业及待遇方面存在差异，前者侧重科研，后者侧重产业；在待遇上，两者领导层的待遇存在差异，而员工待遇在两院间可能有所不同。