清华大学的计算机科学与技术专业的学费设置为正常水平，大约一年5000元左右。相比之下，软件学院的学费则要稍微贵一些。

在清华大学的学科设置中，信息学院包含有电子、计算机、自动化等几个系别。后来，又增设了软件学院。理论上，软件学院和计算机系的地位是平等的，教学质量等方面自然无需多言。有一段时间，软件学院曾试图合并至计算机系，但遭到了计算机系的坚决反对，因此目前二者仍保持独立。

整体而言，清华大学在计算机科学与技术领域的教育投资与学费设定，旨在保证教学质量的同时，也考虑了学生的经济负担。在这样的框架下，不同学院或系别之间的学费差异，更多地体现了教育资源的分配与学科特性的差异。