线粒体呼吸链由五种酶组成，分别是NADH（复合物I）、琥珀酸氧化还原酶（复合物II）、细胞色素C氧化还原酶（复合物III）、细胞色素C还原酶（复合物IV）和ATP合成酶（复合物V）。这些酶通过一系列化学反应，将代谢物上脱下的氢或电子传递给氧气，产生能量。

在细胞中，有三种载体接受代谢物上脱下的氢或电子，它们是NAD+、NADP+和FAD。其中，NADPH并不参与ATP的合成，而是作为生物合成过程中的还原剂。而NADH和FADH2则可以进入呼吸链，参与ATP的生成。

由于在线粒体中，NADH是主要的氧化和电子传递体，而FADH2较少，因此可以将呼吸链分为主呼吸链和次呼吸链。主呼吸链（NADH呼吸链）由复合物Ⅰ、Ⅲ和Ⅳ组成，电子从NADH开始，依次经过这三个复合物进行传递。而次呼吸链（FADH2呼吸链）由复合物Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ组成，电子则不经过复合物Ⅰ，直接由FADH2开始传递。

在呼吸链中，电子的传递是通过一系列氧化还原反应来实现的。每个复合物都有其特定的功能，复合物I能够将电子从NADH传递给辅酶Q；复合物II可以将电子从FADH2传递给辅酶Q；复合物III则将辅酶Q上的电子传递给细胞色素C；复合物IV负责将细胞色素C上的电子传递给氧气；而ATP合成酶则在电子传递过程中，通过质子梯度驱动ATP的合成。

线粒体呼吸链的正常运作对细胞的能量代谢至关重要。它不仅能够产生ATP，还能够调节细胞内的氧化还原状态，从而维持细胞的生理功能。