在上海交通大学，专硕的学费设定为每年12000元，总计三年，即36000元。

学硕与专硕学费的差异主要源自于其不同的课程设置和培养目标。学硕课程以学术研究为主，强调深厚的学术研究能力和科研能力，因此其课程内容更侧重于理论、研究与学术能力的培养，这也使得学硕的学费相对较低。

相比之下，专硕则以职业能力培养为核心，注重实践技能和职业素养的提升，因此其课程内容更加侧重于实践和职业能力的培养，这也使得专硕的学费相对较高。

此外，不同大学、不同专业的学硕和专硕学费也会有所差异，具体情况需要根据各个学校和专业的实际情况进行具体分析。

以上海交通大学为例，学硕和专硕的学费差异主要体现在课程设置和培养目标的不同上。学硕的课程更加注重学术研究，培养学生的学术研究能力和科研能力，因此学费较低。而专硕的课程则更注重实践技能和职业素养的培养，旨在帮助学生更好地适应职场需求，因此学费较高。

值得一提的是，学费的具体数额会因学校和专业而异，学生在选择时需仔细了解具体费用，以便做出明智的决策。

综上所述，上海交通大学的专硕学费为每年12000元，总计三年，共计36000元。学费的高低主要取决于课程设置和培养目标的不同。