苏州目前拥有9所本科院校，其中本土院校7所，中外合作院校2所。本土本科院校包括苏州大学、苏州科技大学、常熟理工学院、苏州大学文正学院、苏州大学应用技术学院、苏州科技大学天平学院和苏州科技大学苏州理工学院。中外合作院校则为昆山杜克大学和西交利物浦大学。

苏州大学是苏州最知名的大学，也是实力最强的之一。它是国家“211工程”、“2011计划”的首批入选高校，并且是教育部与江苏省人民政府共建的“双一流”建设高校。此外，苏州大学也是国家国防科技工业局和江苏省人民政府共建高校，是江苏省属的重点综合性大学。其在软科2020年中国大学排名中位列第38名，超过了部分985院校。

苏州科技大学由原苏州城建环保学院与原苏州铁道师范学院合并组建而成，是一所以工为主，涵盖理、文、管、艺多学科协调发展的全日制普通高校。2017年，它成为了住房和城乡建设部与江苏省共建高校，并且同年获批江苏省博士学位授予立项建设单位。

常熟理工学院位于苏州常熟，这是一座充满人文气息的历史文化名城。它是江苏省省属公立全日制普通本科院校，1958年建校（苏州师范专科学校），并在2004年经教育部批准升本。

昆山杜克大学是一所由美国杜克大学和中国武汉大学合作创办的非营利性中美合办高校，由昆山市人民政府作为合作支持方参与建设。它具有独立法人地位，是一所综合性研究型大学。

西交利物浦大学则是西安交通大学和英国利物浦大学合作于2004年在苏州创立的，具有独立法人和鲜明特色的新型国际大学。这所大学是中国第一所强强合作，并以理、工、管起步的中外合作大学。

苏州大学文正学院和苏州大学应用技术学院是苏州大学的下属独立学院。苏州科技大学天平学院和苏州科技大学苏州理工学院则是苏州科技大学的下属独立学院。