重庆工程学院计算机学院在南泉校区。根据百度地图显示，重庆工程学院是一所应用型本科高校，位于重庆市巴南区，拥有南泉和双桥两个校区。其中，南泉校区位于重庆市巴南区南泉街道白鹤林16号，是学院的主校区，也是计算机学院所在地。双桥校区则位于重庆市双桥经济开发区西湖大道76号。所以，重庆工程学院计算机学院在南泉校区。