东北林业大学隶属于教育部，而东北农业大学则由黑龙江省管理。从规模来看，东北林业大学拥有超过2.7万本科生和0.85万研究生，设有19个学院及1个教学部，提供68个本科专业、10个一级学科博士点和19个一级学科硕士点，其林业工程与林学为“双一流”学科。相比之下，东北农业大学则有2.43万本科生和0.64万研究生，设有16个学院及1个教学部，提供75个本科专业、10个一级学科博士点和22个一级学科硕士点，畜牧学为其“双一流”学科。

两校本科专业有近半数重合，但一级学科博士点的重合度仅约两成，硕士点的重合度在四成到五成之间。这表明两校合并后具有较大的提升潜力。然而，鉴于目前两所大学各自在特定领域深耕，合并可能不太适合。合并后将形成一所超级大学，2022年数据显示，东北农业大学本科录取6219人，研究生2632人；东北林业大学本科录取5025人，研究生3387人。这两所大学的招生规模都不小，合并后招生规模将显著增加，这可能对两校的管理和资源分配带来挑战。