昆明医科大学，原名为云南医学高等专科学校，于昆明医学院合并后筹备更名。云南中医药大学则从原云南中医学院升格而来，正在筹备进一步升级。昆明卫生学校同样位于昆明，专注于基础医学教育。云南新兴职业学院则是从1994年创建的南方民族医学院（专修）发展而来，2006年与云南昆明科技商务学校合并，升格为现在的学院。云南骨伤医学高等专科学校则是从云南省骨伤科中等专业学校筹备升格而来。昆明医学院海源学院也是位于昆明，是昆明医学院的一个分院。

在保山市隆阳区，有保山中医药高等专科学校。在大理市，大理学院和大理卫校共同存在，为当地学生提供了丰富的医学教育资源。德宏州潞西市拥有德宏卫校，为当地学生提供了专科层次的医学教育。在楚雄市，楚雄医药高等专科学校则专注于医药领域的教育。

曲靖市麒麟区有曲靖医学高等专科学校，临沧市临翔区则有临沧卫校，为当地学生提供了医学专科教育。普洱市思茅区和西双版纳州景洪市分别拥有普洱卫校和西双版纳卫校，为这两个地区的医学教育做出了贡献。红河州蒙自县和文山州文山县分别有红河卫校和文山卫校，为当地学生提供了医学教育。玉溪市红塔区则有玉溪卫校，昭通市昭阳区有昭通卫校，丽江市古城区有丽江卫校，怒江州泸水县有怒江卫校，迪庆州香格里拉县有迪庆卫校，这些学校为当地的医学教育做出了重要贡献。