在选择考研考制药工程的专业院校时，我推荐沈阳药科大学、中国药科大学、四川大学、上海交通大学、北京大学、浙江大学、复旦大学、上海中医药大学、中山大学、西安交通大学、华中科技大学、山东大学等几所学校。

沈阳药科大学以其优秀的制药工程学科在行业内享有盛誉，学校拥有雄厚的教学和科研实力，尤其是在药物分析、生物制药等领域有着较高的研究水平。

中国药科大学作为我国历史悠久的药学高等学府之一，其制药工程专业在全国范围内有着极高的评价，特别是在新药研发方面有着强大的科研团队。

四川大学的制药工程专业实力同样不容小觑，学校依托其综合性的学科优势，在制药工程领域有着丰富的教学和科研资源。

上海交通大学、北京大学、浙江大学、复旦大学等国内顶尖高校也拥有优质的制药工程专业，这些学校不仅在学术研究方面具有深厚的积淀，在实践教学方面也提供了丰富的资源。

上海中医药大学作为中医药教育的领头羊，其在中药制药方面的研究独具特色，为学生提供了独特的学习机会。

中山大学作为华南地区的顶尖学府，其制药工程专业在国内具有较高的知名度，特别是在生物制药领域有着较强的实力。

西安交通大学、华中科技大学、山东大学等高校也在制药工程领域有着不俗的表现，它们凭借强大的科研力量和完善的教学设施，为学生提供了良好的学习环境。

总的来说，这些院校在制药工程领域都有着各自的优势和特色，学生可以根据自己的兴趣和职业规划来选择适合自己的学校。