三本与初中毕业在教育阶段、学历层次和就业前景方面存在显著差异。初中毕业是指完成了九年义务教育中的最后一学年，即初级中学的学业，学生将获得相应的毕业证书。而三本则是中国高等教育体系中的一个层次，特指第三批本科院校所颁发的本科毕业证书。

在学历层次上，初中毕业生并未获得正式的学历证书，其教育水平仅达到九年义务教育的基本要求。而三本毕业生则具备本科毕业资格，虽然学术水平和专业深度可能较一本或二本院校略低，但在社会认知中，其学历层次仍然高于初中毕业生。

就就业前景而言，初中毕业生通常会继续升入高中或选择职业学校进行技能训练。相比之下，三本毕业生可以考虑就业或进一步深造。然而，与一本、二本等更高层次的本科毕业生相比，三本毕业生可能在就业市场上面临更多的竞争压力。

总的来说，初中毕业和三本代表了不同的教育阶段和学历层次，对学生的学业发展和就业前景有着重要影响。初中毕业强调九年义务教育的完成，而三本则标志着本科教育阶段的开始，两者在社会认知和职业发展上有着显著的区别。