南京理工大学最好的专业是工程学。

工程学在南京理工大学是一门备受推崇的专业，这主要源于学校强大的学科实力和优质的教学资源。首先，南京理工大学的工程学学科在国内具有较高的排名，这在很大程度上反映了其教学质量和研究水平。其次，学校拥有一支经验丰富、学术水平高的教师队伍，他们不仅具有丰富的实践经验，还在工程领域中取得了丰硕的科研成果。

工程学专业的课程设置和实践环节也非常出色。南京理工大学注重培养学生的实践能力和创新思维，通过实验室项目、实习实训等方式，使学生在实际操作中掌握理论知识，提高解决问题的能力。此外，学校还与多家企业合作，为学生提供实习和就业机会，帮助学生顺利实现从学生到职场人的转变。

综上所述，南京理工大学最好的专业是工程学。这一结论基于学校强大的学科实力、优质的教学资源、出色的课程设置和实践环节等多方面因素的综合考虑。希望这些信息能够帮助你对南京理工大学的专业有更深入的了解。