合肥职业技术学院巢湖校区好。

1、师资力量：合肥职业技术学院巢湖校区，师资力量上有教职工796名，其中专任教师599人，教授（正高）58人，副高以上职称教师209人，“双师型”教师313人，而阜阳职业技术学院，师资力量有教职工466人，其中专任教师425人，正高级职称26人，副高级职称98人，高职“双师型”教师193人，即合肥职业技术学院巢湖校区的师资力量好。

2、办学条件：合肥职业技术学院巢湖校区，开设11个二级学院、56个招生专业，设有安徽广播电视大学合肥职业技术学院分校，而阜阳职业技术学院，开设8个二级学院，41个招生专业，即合肥职业技术学院巢湖校区的办学条件好。