区别在于录取批次和学历层次、招生标准、师资力量。

1、录取批次和学历层次：二本是在普通高等学校招生全国统一考试结束后，处于本科第二批次录取的院校，主要以尚未更名为大学的地方应用型本科学院为主。三本则是第三批次录取的本科院校。目前许多省份已经取消了本科第三批次，将其合并到本科第二批次录取，但完成学业后，二者都会授予国家承认的本科学历。

2、招生标准：二本学校的招生标准通常比三本学校高，录取的学生综合素质和能力要求更高。

3、师资力量：二本学校的师资力量相对较强，教学质量也较高，而三本学校的师资力量相对较弱，教学质量也相对较低。二本学校往往拥有更多具有高学历和专业背景的教师，且在教学设施和资源方面投入较多。