纳税人开票小数点后两位都会四舍五入出现该差异的原因是由于纳税人开票小数点后两位都会四舍五入，开票系统合计税额的计算方式为每一张发票的税额相加，而在增值税申报表中的计算公式为：税额=总销售额*适用税率，所以就会出现几分钱的差距。