二级建造师的初始注册与转注册在流程和时间上存在明显差异。初始注册指的是通过执业考试并获得资格证书后，在未进行过任何注册的情况下，首次进行注册的过程。这一过程通常需要较长的时间，从注册申请到最终注册成功，大约需要三个月左右。

相比之下，转注册则是在首次注册之后，由于合作期限到期或因工作变动需要更换工作单位时，将资格证书从原公司转到新公司的注册过程。这一过程通常较为简便快捷，如果一切顺利，通常只需1-2周时间即可完成。

在初始注册阶段，建造师需要提交一系列材料，包括资格证书、身份证明、工作经历证明等，经过审核后才能正式注册。而转注册则相对简单，只需提交转注申请及相关证明材料，审核通过后即可完成。

值得注意的是，无论是初始注册还是转注册，都必须遵循国家相关法律法规，确保注册信息的真实性和完整性。同时，转注时还需注意新旧公司的资质要求及合同协议，以确保顺利过渡。