五年一贯制高职和五年制大专的主要区别在于学位和学校设置。

1. 学位：

五年一贯制高职毕业后可以获得“高职专科学士学位”，而五年制大专毕业后只能获得“专毕业证书”，无学位授予权。

2. 学校设置：

五年一贯制高职通是由部属高职院校、公办高职院校和民办高职院校开设的；而五年制大专一般由普通高等院校和职业高等院校开设。

3. 课程设置：

五年制大专在前三年学习大学专业基础课程，后两年学习专业知识和技能课；而五年一贯制高职基本上一直学习与所学专业相关的知识和技能。

4. 招生对象：

五年制大专可以招收高中毕业生和职业学校毕业生，而五年一贯制高职一般是招收中职毕业生。