清溪镇目前拥有三所高中学校，其中两所为新建的民办高中，一所为公、民办高中。东莞高级中学（集团）清溪中学作为其中一所公、民办高中，今年的录取分数线为本市户籍考生第一至第四志愿分别为584分、589分、594分和599分，随迁子女考生分别为627分、632分、637分和642分。该中学还设置了排位录取条件，详细分数要求包括：本市户籍考生第一志愿各科总分需达583分以上，第二志愿588分以上，第三志愿593分以上，第四志愿598分以上，且组合1（语数英）总分需达261分以上；随迁子女考生第一志愿各科总分需达626分以上。

东莞高级中学（集团）清溪中学计划于2020年秋季学期开始普通高中招生，今年秋季的招生计划为6个班，共计300名学生。另一所新建的民办高中东莞市海德双语学校公费生第一至第四志愿分别为672分、677分、682分和687分，自费生分别为600分、605分、610分和615分。值得一提的是，该校公费生第一志愿录取分数线为672分，居全市新建民办高中第二位。东莞市海德双语学校计划于今年9月开学，首年开设12个高一班级，招生600人，包括公费生40人，对接大学“强基计划”和学科竞赛40人，音乐、体育、美术、播音主持特长生40人。

另一所新建的民办高中东莞市华中师大附属中学的公费生第一至第四志愿分别为543分、548分、553分和558分，自费生分别为500分、505分、510分和515分。该学校计划于今年9月开学，首年开设12个高一班级，招生600人，其中包括公费生40人、对接大学“强基计划”和学科竞赛40人，音乐、体育、美术、播音主持特长生40人。