企业进行土地增值税相关会计处理时，需明确如何计入科目。对于兼营房地产业务的企业，应将应交的土地增值税计入“营业税金及附加”科目。

对于企业转让土地使用权，并且土地使用权与地上建筑物及其附着物一并在“固定资产”等科目核算的情况，应借记“固定资产清理”等科目，贷记“应交税费——应交土地增值税”科目。

当土地使用权在“无形资产”科目核算时，企业需按实际收到的金额借记“银行存款”科目，按摊销的无形资产金额借记“累计摊销”科目，按已计提的无形资产减值准备借记“无形资产减值准备”科目，按无形资产账面余额贷记“无形资产”科目，按应交的土地增值税贷记“应交税费——应交土地增值税”科目。最后，将二者差额计入“营业外支出”或“营业外收入”科目。

企业计算应交的房产税、土地使用税、车船税、矿产资源补偿费时，应借记“管理费用”科目，贷记“应交税费”科目。