阿坝县教育局所属学校有会理县民族中学、会理县第二中学、卧龙特区中学、马尔康县中学、九寨沟县中学。

1、会理县民族中学

会理县民族中学是1988年经四川省教育厅批准成立的重点寄宿制民族高完中。学校占地面积15805平方米，建筑面积20489平方米。现有23个教学班，其中初中21个班，高中2个班，在校学生1369人有在职教职工88人，其中专任教师67人。

学校的主要职责和服务范围是：完成上级下达的招生计划任务，在会理县全县范围内招收以少数民族学生为主要的初中、高中学生，进行初中义务教育和高中学历教育。

2、会理县第二中学

会理县第二中学，创建于1940年，是一所公立学校。其前身为“四川省国立金江职业学校”，1958年更名为会理县初级中学，1986年经四川省教厅批复为高完中。

坚持以“形象求效益，质量求生存，特色求发展”的办学思路；努力挖掘学校内部潜力，走校本培训的育师之路，派骨干教师到外地学习交流，参加各类师资培训、请川师大外籍教师来校讲学。

3、卧龙特区中学

卧龙特区中学，坐落在卧龙自然保护区，新校园错落有致，古朴典雅，是一所寄宿制完全高级中学。学校占地42002平方米，建筑的外墙均采用石片装饰，具有浓郁的藏羌民族风格，无D级危房。

学校以鼓励学生“每天进一步”为办学理念，以培养学生主体意识、实践能力和创新精神为重点，创办适合学生发展的教育。探索"养成教育”实施途径。

4、马尔康县中学

四川省马尔康中学校坐落于雪域明珠阿坝州府所在地马尔康。学校东临中国财产保险公司阿坝分公司，西连阿坝州业余体校，南靠巍峨大山，北与州人民银行相接，与梭磨河紧相依偎。

学校以“一高两特”的发展思路和“质量立校，特色活校，科研兴校，创新强校”为宗旨，因人而异，因材施教。采取“分层教学、动态管理、分类推进、整体提高”的教学管理策略。

5、九寨沟县中学

九寨沟县中学校创办于1958年，其前身为南坪初级中学、南坪县中学，1998年正式更名为九寨沟县中学，是一所州级示范性普通高中学校。

学校新组建的领导班子以科学发展观为指导，确立“走现代教育创新之路，实现‘九中’跨越式发展”为办学思路，以“砺志、笃学、求是、创新”为校训。