支付宝付款应记入银行存款科目。

详细解释如下：

支付宝付款其实质是通过支付宝平台进行的一种银行转账行为。当使用支付宝进行付款时，账户里的资金实际上是从银行账户转移到支付宝账户，最终支付给收款方。因此，对于记账而言，支付宝付款应当视为银行存款的一种变动。

具体来说，当使用支付宝付款时，资金从企业的银行存款账户中被划出。所以，在会计记账时，支付宝付款的金额应该记入银行存款的减少科目。与此同时，如果有对应的收款账户，那么收款账户的银行存款会增加。这样的记账方式能清晰反映企业的资金流动情况，便于企业进行财务管理和资金调配。

支付宝作为一种便捷支付方式，其背后涉及的资金流动仍需遵循基本的会计记账原则。正确认识并合理运用会计科目，有助于企业准确记账，保证财务数据的真实性和完整性。对于企业和个人而言，了解不同支付方式的会计处理方式，是财务管理的基础，也是保障经济交易透明的重要一环。