北京航空航天大学设有多个学院，每个学院都有其独特之处。材料科学与工程学院专注于航空动力工程，尤其在喷气发动机领域全国领先。电子信息工程学院和自动化科学与电气工程学院则分别在电子信息技术和自动化控制方面有着深厚的底蕴。能源与动力工程学院专注于航空动力工程研究，特别是飞机发动机的开发。

航空科学与工程学院是北航的拳头专业，该学院在航空领域享有盛誉，其专业水平在全国首屈一指。计算机学院是北航的重要组成部分，其计算机科学与技术专业排名全国第三，仅次于国防科技大学和清华大学。微软亚洲研究院为该学院提供了强大的技术支持，使得该学院在业界享有极高的声誉。

机械工程及自动化学院是北航最早设立的学院之一，目前已经成为北航的第一大院。该学院设有机械设计、机械制造、机电、工业制造工程、材料成型、飞行器制造和工业设计等专业方向，毕业生就业前景良好。经济管理学院虽然在学术界声名不显，但学院内美女众多。

理学院汇聚了众多高智商人才，虽然在理科方面不及南开大学等名校，但其科研实力依然不容小觑。生物工程系和人文社会科学学院则分别关注生命科学和人文社科领域，其中人文社会科学学院同样美女众多。

交通科学与工程学院原名汽车工程系，专注于航空运输和汽车技术研究。工程系统工程系由杨为民教授一手创建，该系专注于系统可靠性工程，主要应用于航空领域，具有全国唯一的学科地位。宇航学院虽然在航天领域的实力不如哈尔滨工业大学，但在国内依然属于一流。

飞行学院主要为南方航空公司培养飞行员和地勤人员，采用全军事化管理，严格筛选学员。仪器科学与光电工程学院在航电技术领域处于领先地位，中国大部分飞机都使用了该学院研发的航空电子技术。

土木工程系和法学院也在各自的领域拥有一定影响力。虽然法学院曾受到北大院长的批评，但近年来该学院的航空法研究实力显著增强，同时美女数量也不少。