在选择二本学校自动化专业考研学校时，以下几所院校值得重点关注：

西安电子科技大学位于中国西部，以电子信息技术见长，自动化专业在行业内享有较高声誉，具有较强的科研实力和教学水平。

中国矿业大学作为一所以矿业为特色的综合性大学，其自动化专业在能源与矿业自动化领域具备优势，科研成果丰富。

合肥工业大学在工业自动化、控制工程等领域拥有良好的教学和研究基础，尤其在智能控制方面有显著成就。

西南交通大学依托其轨道交通优势，自动化专业在轨道交通自动化、智能系统等方面有深厚积累。

湖南大学的自动化专业在控制科学与工程、智能系统等方面有显著优势，培养了大量高层次人才。

燕山大学在自动化与信息工程领域有较强的实力，特别是在智能机器人、自动化控制方面有突出成就。

吉林大学自动化专业教学与科研并重，涵盖了多个自动化相关学科，培养了大批优秀毕业生。

哈尔滨工程大学依托其在船舶与海洋工程、自动化等领域的优势，自动化专业在船舶自动化、海洋工程自动化方面有显著特色。

河北工业大学自动化专业在机器人技术、智能控制等领域有较强的研究实力和教学水平。

福州大学自动化专业在智能制造、控制理论与应用等方面有较好的基础和研究方向。

东华大学自动化专业依托其纺织工程、服装设计等优势学科，融合自动化技术，形成了特色鲜明的研究方向。