复旦大学和上海交通大学都是国内超一流的名校，两者综合实力和声誉差不多，复旦大学声誉稍微更高点，但是高考录取分数线两者是几乎一个档次的，都很难考上。具体到学科上，复旦大学的文、理学要比上海交通大学强，而上交的工科要比复旦大学强，两者的医学实力都很强。